En brote padecido en Canadá se ha demostrado que C. difficile ha evolucionado hacia una cepa con mayor facilidad de diseminacion y màs poder patogènico. ha sido mediante la comparaciòn del genoma de cepas aisladas hace varios años con cepas actualmente aisladas.
Estas cepas " hipervirulentas" pertenecen al PCR-ribotipo 027.
http://genomebiology.com/2009/10/9/R102
presenta 5 nuevas regiones, que no aparecen en cepas anteriores del mismo PCR-ribotipo, donde se encuentran genes que regulan motilidad, toxicidad, regulación de la transcripción y resistencia a fármacos.
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