lunes, octubre 05, 2009
Investigación basica
jueves, octubre 01, 2009
Posibles causas de mayor afectación en "jóvenes"
http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=19344
martes, septiembre 29, 2009
Mutación detectada en virus de la gripe
"INFLUENZA PANDEMIC (H1N1) 2009 (58): THE NETHERLANDS, PB2 MUTATION
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A ProMED-mail post
Date: Mon 28 Sep 2009
From: Marion Koopmans
We would like to report 2 patients in The Netherlands, diagnosed with
influenza pandemic A(H1N1) 2009 virus infection that had a mutation (E627K)
in the basic polymerase 2 (PB2) protein. This mutation has previously been
associated with increased efficiency of replication and possible virulence
changes in other influenza A viruses.
The investigation identified a specific geographic region in the north of
The Netherlands as the place where viruses with the same genetic background
have circulated between mid July and mid August [2009]. No other cases
carrying the PB2 mutation have been identified.
On 15 Sep 2009, the 1st influenza A(H1N1)v virus with a glutamic acid to
lysine mutation at position 627 (E627K) in PB2 was identified through
routine sequence analysis of clinical samples from a diabetic patient
infected with A(H1N1)v virus. The 1st day of illness was on 9 Aug 2009,
when the patient was vacationing on one of the West Frisian Islands in the
wetlands north of The Netherlands (Waddenzee). He had a relatively mild
course of illness. Subsequent retrospective tracing of geographically
linked A(H1N1)v cases from the national databases led to the identification
of 24 additional A(H1N1)v confirmed cases throughout the country that had
stayed on the same popular holiday island during July and August. Sequence
analysis of 12/24 clinical specimen available at the institute identified
10 A(H1N1)v viruses that clustered with the virus obtained from the
diabetic index patient based on unique mutations in the NA gene and PB2
gene. Only one of these had the PB2 E627K mutation. This virus was isolated
from a family contact of an adolescent girl who returned from a one-week
stay on the same island on Mon 20 Jul 2009 with high fever and coughing.
This girl had been camping with a group of 16 boys and 8 girls that shared
2 tents. Almost all members of this group reportedly had been ill, and
influenza A(H1N1)v infection had been diagnosed in 2 other persons
belonging to the same camp. The girl was ill for a week, with full recovery
after 2 weeks. Our 2nd case with a virus shedding carrying the PB2 mutation
is the younger sister and became ill on Thu 23 Jul 2009. She was treated
with oseltamivir and recovered fully after one week. Both parents remained
free from symptoms.
As the mutations were identified more than one month after initial
detection, no further contact investigations were done. Municipal health
services were informed about the local disease activity. Since 15 Aug 2009,
mild influenza cases are no longer notifiable in The Netherlands, so we
have no information on possible onward transmission. No clusters of illness
(for example, from schools) were reported in the health regions involved
(including the island), and surveillance data from a national
physician-based sentinel network showed low ILI activity for the
Netherlands. Samples from 22 patients hospitalized with influenza A(H1N1)
in July and August did not have the PB2 mutation.
PB2 627K is consistently found in human influenza A viruses, but rarely in
avian-derived viruses. The E627K mutation may result in enhanced virus
replication efficiency in humans, possibly by adjustment to host body
temperature or cellular cofactors, and has previously been shown to be
associated with fatal cases of HPAI H5N1 and H7N7 virus infection in
humans. Until now, A(H1N1)v viruses with Influenza pandemic (H1N1) 2009
(57): in PB2 have not been reported, and the clinical and epidemiological
relevance of our finding remains unclear.
Preliminary experiments in ferrets using reverse genetics-derived new
influenza A(H1N1)v viruses with the E267K mutation in PB2 did not indicate
increased shedding, virulence or transmissibility. Further experiments as
well as increased molecular surveillance to monitor the situation are ongoing.
communicated by:
Marion Koopmans
Chief of Virology
Laboratory for Infectious Diseases and Screening, Center for Infectious
Disease Control
National Institute of Public Health
The Netherlands
[ProMED-mail thanks Dr Koopmans and colleagues for providing this
interesting information recording the detection of the same E267K mutation
in the basic polymerase 2 (PB2) protein of 2 independent isolates of
A(H1N1)v in the north of The Netherlands. The functional relevance of this
mutation remains to be determined. - Mod.CP]"
lunes, septiembre 28, 2009
Nuevas cepas de C. difficile.
Estas cepas " hipervirulentas" pertenecen al PCR-ribotipo 027.
http://genomebiology.com/2009/10/9/R102
presenta 5 nuevas regiones, que no aparecen en cepas anteriores del mismo PCR-ribotipo, donde se encuentran genes que regulan motilidad, toxicidad, regulación de la transcripción y resistencia a fármacos.
jueves, septiembre 24, 2009
Hay que estudiar HPV en cancer orofaringeo
martes, septiembre 01, 2009
Evolución de la gripe en Invierno
- Varias cepas de virus de la influenza han circulado, con predominio de la nueva cepa A H1N1 09
- Mayor número de casos notificados entre los menores de un año (a prepararse los pediatras)
- Pico muy ligero de casos coincidente con la vuelta a clase, menor de lo esperado.
- La tasa de fatalidad está en el rango habitual de la influenza estacional para los menores de 65 años (Los avances médicos actuales es una posible causa a que los datos no sean similares a los de 1918: antibióticos, antivirales, cuidados intensivos).
- La tasa de notificación de gripe entre los mayores de 70 años es la más baja entre todos los grupos de edad.
- Estimación de infección sintomática en 7,5 % de la población.
martes, mayo 05, 2009
¿reactividad cruzada?
Se apunta que es la población más joven la que más viaja y que en este brote se contagia más. Sin embargo ya en sus inicios, lo que en Mexico llamó más la atención, era precisamente eso, que afectaba más a la población joven del punto origen.
Otra posibilidad no muy comentada es que quizás haya inmunidad cruzada con otros virus H1N1 que remotamente en el tiempo haya circulado por el globo, hace unos 40 años. Esto puede apuntar que si en la vacuna que está en producción este año hay alguna cepa H1N1 pueda ofrecer alguna inmunidad aunque especificamente no se introduzca el virus causal del brote.
sábado, mayo 02, 2009
¿Vacuna para el virus influenza A H1N1?
Hasta final de Mayo no pondrá el CDC a disposición de las companias la cepa patrón de este brote de influenza. Una vez con ella, las companias tardarán en adaptar el proceso a la nueva cepa, así como establecer su eficacia respecto a concentracion de antigeno y seguridad. Añadimos la dificultad de necesitar dos dosis para lograr una buena inmunidad para una cepa nueva.
La posibilidad barajada por algunas firmas es la de elaborar dos vacunas, la estacional de la gripe, que ya esta en proceso y que frenarla supondría un gran retraso, y la este brote de gripe.
Las pocas firmas que pueden desarrollar una vacuna a su tiempo, como Novavax, usarían metodología y protocolos no habituales de los que no tenemos pruebas de su eficacia. (en el proceso actual ya tenemos experiencia y conocemos su eficacia).
En resumén, que parece que esta cepa de influenza no será incluida en la vacuna del año que viene.
domingo, abril 26, 2009
jueves, abril 23, 2009
La evolución bacteriana
La variación detectada en Chlamydia trachomatis no se debe a la presión antibiótica. Se debe, aquí lo novedoso, a la presión diagnóstica. Chlamydia trachomatis presenta una delección de 377 pares de bases en el plasmido usado como diana para su detección mediante técnicas moleculares. Así la detección de la secuencia diana en el plásmido en una muestra clínica motiva la administración de un antibiótico anti-clamidia al paciente. Pero los pacientes infectados por la cepa con la variación en la secuencia diana empleada en la detección no reciben tratamiento anticlamidia, favoreciendo su diseminación y permitiendo a esta cepa variante ocupar el nicho que ocupaba la cepa salvaje.
Cuando nos creíamos que con técnicas moleculares podríamos detectar todos los gérmenes que tuvieramos secuenciados ahora resultan que se nos escapan. ¿No suena esto igual a cuando creíamos que con los antibióticos podríamos controlar a todos los gérmenes y estos gérmenes se nos escaparon?
- Unemo M, Olcén P, Agné-Stadling I, Feldt A, Jurstrand M, Herrmann B, Persson K, Nilsson P, Ripa T, Fredlund H. Euro Surveill. 2007 Apr 1;12(4):E5-6.
- Ripa T, Nilsson PA. Sex Transm Dis. 2007 May;34(5):255-6.
- Herrmann B, Törner A, Low N, Klint M, Nilsson A, Velicko I, Söderblom T, Blaxhult A. Emerg Infect Dis. 2008 Sep;14(9):1462-5.
domingo, agosto 29, 2004
sinusitis bacteriana aguda
Sin embargo se reflejan varios puntos consecuencia de un análisis exhaustivo de la literatura.
- la mayoría de las sinusitis agudas presentes en una consulta de atención primaria son virales.
- dos tercios de los pacientes mejoran sin tratamiento antibióticos. El tratamiento antibiótico reduce a la mitad la tasa de fallos terapeuticos.
- El uso de antibióticos "más antiguos" (amoxicilina, trimetoprim/sulfametoxazol, doxiciclina) obtiene tasas de resolución similar a antibióticos "más nuevos" (claritromicina, azitromicina, amoxicilina/clavulánico)
- La tasa de efectos secundarios a tratamiento antibiótico no es despreciable, desde el 25 al 50 % de los pacientes tienen efectos secundarios. Amoxiciclina/clavulánico produce más efectos secundarios que azitromicina.
- En alérgicos el uso de antihistamínicos y/o corticoides nasales tópicos junto con los antibióticos aceleran la resolución de los síntomas e incrementa la tasa de curación global. En los no alérgicos no hay evidencia que los antihistamínicos o esteroides intranasales modifiquen la evolución de la sinusitis aguda
Refleja esta publicación la publicación de una guía donde se recomienda tratamiento sintomático (analgesicos y descongestionantes nasal) y reevaluar el paciente a las 72 horas.
Quizas en aquellos casos que se considere necesario se puede prescribir tratamiento con amoxicilina, doxiciclina y si a las 72 horas no se produce mejoría se cambiaría el tratamiento a amoxicilina/clavulanico o una cefalosporina oral.
martes, agosto 17, 2004
Diagnostico de Epstein Barr
- VCA IgG
- VCA IgM
- EBNA-1"
"En individuos inmunocompetentes solo tres posibles diagnosticos son relevantes:
- Infeccion primaria o aguda como una causa de mononucleosis.
- Infeccion pasada que exculye mononucleosis
- ausencia de anticuerpos específicos del virus Epstein Barr que indica susceptibilidad de infección por Epsteina Barr"
"Mientras que anticuerpos EBNA-1 IgG aparecen muy tarde en el curso de la infeccion, los anticuerpos EBNA-2 IgG aparacen mas temprano y pueden presentarse hasta en el 30 % de los pacientes en el cominezo de la enfermedad"
" Los fabricantes de kits de inmunofluorescencia que usan células Raji para la determinación de EBNA deben tener en cuenta el hecho de que las células Raji producen EBNA-1 y EBNA-2, antigenos que no pueden discriminarse por inmunofluorescencia"
Hess, R.D. Routine Epstein-Barr virus diagnosis from the laboratory perspective: still challenging after 35 years. Journal of Clinical Microbiology. 2004;42(8):3381-3387.
miércoles, junio 16, 2004
Utilidad de DNA de Epstein-Barr en control de pacientes con carcinoma nasofaringeo
Los pacientes del grupo de estudio (101) tenían carcinoma nasofaringea sin evidencia de matastasis distante, mientras que el grupo control lo conformaban 40 voluntarios sanos, 20 pacientes que habían sobrevivido 5 años al carcinoma nasofaringeo tras la radioterapia y 19 pacientes con mestátasis a distancia.
Se detectó DNA de EBV en plasma en 94 de 99 pacientes, pero en ninguna de las muestras de plasma de los 40 voluntarios sanos o 20 pacientes dados por curados del carcinoma nasofaringeo. Aquellos que tenían recaida (18) tenían una carga viral más elevadas que los que no tenían recaida del proceso tras la radioterapia. Y la elevación de los niveles de DNA en 8 de estos pacientes ocurrió 6 meses antes de que la recaida se detectara clinicamente.
A la semana de finalizar la radioterapia solo en 10 de los 99 pacientes se detectó DNA de EBV. Siete de estos 10 tuvieron una recaida posterior y uno tuvo una metastasis a distancia más recurrencia en cuello.
Así se pueden obtener varias conclusiones:
- en el momento de presentación de la enfermedad, una carga viral elevada se asocia con recurrencia.
- tras la quimioterapia la ausencia de negativización de la carga viral se asocia con recurrencia.
- la elevación de la carga viral respecto de un control previo se asocia con recurrencia
martes, junio 08, 2004
Incentivos en medicina
Desde el punto de vista ético el médico debe actuar solo movido por el interés de su oaciente cuando realiza decisiones clínicas, no en función de su propio interés finaciero ni en el su organización de salud. Se supone que el médico pone el interés de su paciente en primer lugar no el de la sociedad o el de terceras partes. Sin embargo muchas incentivos económicos para el médico no son necesariamente para interés de su paciente.
Los dirigentes de salud en la mayor parte del mundo hoy se acogen al empleo de incentivos para el médico sin realizar ninguna crítica, no teniendo en cuenta sus problemas y riesgos. Deberían tratar estos incentivos como fármacos- un producto que puede ser beneficoso pero tambien peligroso
sábado, mayo 15, 2004
Infección tuberculosa latente
Priorities for the Treatment of Latent Tuberculosis Infection in the United States. NEJM. 2004;350:2060-2067.
miércoles, abril 21, 2004
Tratamiento de vaginitis por Candida no albicans
Tratamiento de candidiasis vaginal
Primero tenemos que preguntar quien llega al diagnóstico de especie en todos los aislamientos de Candida en frotis vaginal. No es desde luego una práctica muy extendida. Si no llegamos al diagnóstico de especie dificilmente el clínico puede prescribir un tratamiento basado en la evidencia.
Mi pregunta es, el ácido bórico ¿como se aplica?¿existe como fórmula magistral?¿Existe una formulación de flucitosina tópica aprobada en España no publicada en Vademecum?
martes, abril 06, 2004
Simvastatina disminuye en el desarrollo de linfomas por Epstein Barr
PNAS -- Abstracts: Katano et al. 101 (14): 4960
miércoles, marzo 10, 2004
Un marcador de infección por Hepatitis B predictor de carcinoma hepático
Aquí pordríamos tener un marcador muy importante para evaluar la necesidad de tratamiento de una hepatitis B crónica. Si se identifica una mutación en el genoma del virus de la hepatitis B en un enfermo tenemos una alta probabilidad de que desarrolle carcinoma hepático antes de los proximos 10 años. Esto desde hay que confirmarlo en otras areas geográficas para ver si este marcador tiene posibilidad de usarse fuera de China.
domingo, marzo 07, 2004
SARS, va a cumplir ya un año
Transmisión: El virus se ha detectado por PCR en infecciones respiratorias, heces orina y tejido pulmonar. El periodo de incubación fue de 2 a 10 días aunque en recientes estudios se esteablece un máximo de 20 días. Los casos asintomáticos se consideran muy raros y no parecen ser importantes en las transmisión. La transmisión es más importante en aquellos que presentan una enfermedad más grave. Antes de la aparición de los síntomas no se ha demostrado la posibilidad de transmisión. El principal mecanismo de transmisión es respiratorio.
Cuadro clínico: Se presenta inicialmente con fiebre, mialgias, malestar, escalofrios y tos. Distinto a otras infecciones respiratorias comunes es que no hay síntomas de infección de vías aereas superiores y es muy frecuente la aparición de una diarrea acuosa. La radiografía de torax es anormal en 60 a 80 % de los pacientes. Aunque un tercio de los pacientes presentan desde este punto mejoría clínica, dos tercios presentan una enfermedad progresiva con tos persistente, disnea, descenso en la saturación de oxígeno y una radiografía de torax más aparatosa. Un signo radiológico característico de la infección por SARS es la aparición de neumomediastino que aparece en algunos casos. Del 20 al 30 % de los casos requieren ventilación mecánica.
Diagnóstico: El estandard ideal es la seroconversion mediante inmunofluorescencia indirecta o ELISA, obteniendo la muestra de suero preferiblemente a los 28 días de comienzo de la infección. El estudio de IgM no permite un diagnóstico serológico más prematuro. El método preferido de detección viral es a PCR-RT cuantitativa en tiempo real usando una modificación en el método de extracción de RNA. Este método premite la detección viral en aspirado nasofaringeo en el 80% de los casos. Métodos anteriores de PCR solo permiten el diagnóstico en 20 % de las mismas muestras. Las secreciones respiratorias son difíciles de obtener debido a la carencia de una tos productiva.
Tratamiento: Aunque no se ha publicado beneficio con ninguna modalidad terapeutica, los estudios in vitro apuntan a un uso potencial de interferon beta. A diferencia de otras infecciones respiratorias, la carga viral en secreciones respiratorias se incrementa conforme avanzan los días de enfermedad alcanzando su máximo al decimo día del proceso. Algunos pacientes presentan en la segunda semana de enfermedad un deterioro en su estado clínico, cuando la carga viral comienza a descender, y hay alguna evidencia de que los esteroides son útiles en esta fase, sugiriendo una alteración inmunopatológica
The Severe Acute Respiratory Syndrome. N Engl J Med. 2003;349:2381-2382