sábado, octubre 25, 2003

A ver ya si puedo explicar que es el genotipado MIRUs de una manera clara.

Este método realiza el tipado de las micobacterias mediante un código numérico que corresponde al número de repeticiones en 12 loci diferentes de unas secuencias genética denominadas "mycobacterial interspersed repetitive units" (MIRUs)

Las repeticiones de estas secuencias son detectadas por PCR. Se emplea un PCR multiplex en la cual se usan como cebadores oligonucleotidos correspondientes a las regiones adyacentes a estas secuencias genéticas repetitivas que se identificaron en el genoma de M. tuberculosis H37Rv.

Se emplean 4 "mezclas de PCR multiplex", cada una dirigidas a tres de estos locus identificados con secuencia repetidas, estudiandose así 12 loci. En cada "mezcla de PCR multiplex" los primers de cada pareja de oligonucleotidos son marcados con una molécula distinta pudiendose de esta manera identificar el producto amplificado de cada unos de los 12 loci.

El producto amplificado de cada cepa a estudiar se somete a un secuenciador estimandose el tamaño de los fragmentos amplificados. Los datos obtenidos fueron sometidos a análisis mediante software. El número de unidades repetidas en cada locus se calcula mediante el tamaño de los fragmentos amplificados con primers específicos de las regiones que bordean los MIRUs.

Si esto aún no ha quedado claro recomiendo leer:

Automated High-Throughput Genotyping for Study of Global Epidemiology of Mycobacterium tuberculosis Based on Mycobacterial Interspersed Repetitive Units. Philip Supply, Sarah Lesjean, Evgueni Savine, Kristin Kremer, Dick van Soolingen, and Camille Locht. J. Clin. Microbiol. 2001.39:3563-3571.

lunes, octubre 20, 2003

Se ha publicado una breve revisión sobre los métodos de tipado moleculares de micobacterias, en New England Journal of Medicine, en la cual se describen someramente distintos métodos.

En ella se reseña también que han aportado estas técnicas en la compresión de la transmisión, patogenia y evaluación de los programas de control de la infección.

Sin embargo una de las técnicas no está descrita claramente y para quien no maneje este tema, como es mi caso, puede ser dificil de comprender. Esta técnica a la que me refiero es el genotipado MIRUs (mycobacterial interspersed repeat units) y que no me atrevo a traducir.

A juicio de los autores de la revisión esta técnica se promete adecuada para su aplicación de manera rutinaria. Permitiria identificar paceintes infectados por la misma técnica varios días después de una baciloscopia. Estos pacientes pueden ser interrogados inmediatamente despues de ser diagnósticados pudiendo ser una herramienta importante para identificar lugares de transmisión y focos de infección posibilitando una actividad más intensiva de los preventivistas en el control de la tuberculosis.

Molecular Epidemiology of Tuberculosis. Peter F. Barnes, M.D., and M. Donald Cave, Ph.D. New England Journal of Medicine. 2003;349:1149-1156

Espero contar en otro escrito como "funciona" esta técnica. Eso cuando me entere.

martes, octubre 14, 2003

S.S. Lee y cols publican un grupo de factores pronosticos que nos pueden permitir predecir una respuesta viral sostenida en el tratamiento con alfa-2a interferon pegilado. Establecen estos factores pronosticos analizando tres estudios que englobaban 814 pacientes tratados con interferon pegilado.

Variables independientes asociados con una respuesta sostenida fueron:
- un genotipo viral distinto al 1
- baja carga viral previamente al iniciar el tratamiento.
- edad menor de 40 años
- ausencia de cirrosis
- peso corporal menor a 85 kg

Un descenso menor de 2 logaritmos en la carga viral en la semana 12 predice también una respuesta sostenida, con un valor predictivo negativo del 98 %.

Lee SS, Heathcote EJ, Reddy KR, Zeuzem S, Fried MW, Wright TL, Pockros PJ, Haussinger D, Smith CI, Lin A, Pappas SC. Prognostic factors and early predictability of sustained viral response with peginterferon alfa-2a (40KD). J Hepatol. 2002;37(4):500-6.

domingo, octubre 12, 2003

En el diagnóstico de las infecciones respiratorias por Nocardia spp. la tinción más sensible es la tinción de Gram. La sensibilidad de la tinción ácido-alcohol resistente modificada es del 51 % respecto a la tinción de Gram. La tinción ácido-alcohol resistente solo debe ser usada para confirmar la ácido-alcohol resistencia de formas compatibles con Nocardia observadas en el Gram.

Nocardiosis. Review of Clinical and Laboratory Experience. Journal of Clinical Microbiology, 2003;41(10):4497-4501.